姜是老的辣孙元起觉得有些汗颜，旋即想到：“单这设立学部就要半年多时间，到那时候，宝大人的奏折肯定已被忘到九霄云外。再说，宝大人奏折上的三条建议，其中改教员为职官、统一学生服装两条都需要大力气、大投入来做，朝廷定然是不肯的；至于统一教科书，则属于吃力不讨好，学部也不会主动揽这麻烦事儿。所以说，这统一教科书的想法只能是胎死腹中，我也不用搀和到里面去”
老大人点点头，又摇摇头：“这教科书的问题，学部在未来一两年间自然不会着手去做。不过，百年大计，教育为本，朝廷绝不会放任教科书五花八门、鱼龙混杂的。而以后要统一，第一步依然是宝熙所提的先行审定各种教科书人无远虑，必有近忧。如果你们现在着手准备，到时候便可以从容应对。”
孙元起这时已经有了主意，回去之后双管齐下：
首先，收集现有的各种教材讲义，借以进一步完善经世大学编纂的教科书体系。然后在全国范围内大力推广，争取在学部审定教科书之前，造成一个既定事实：尽管经世大学的教科书不是官方审定授权的，但在全国已经处于主流地位。官方只要不逆潮流而动，只能默认现实。
其次，商务印书馆争取和某省官书局合作，成立合资企业，使之具有官方背景，然后以官方名义出版全套丛书。这样，以后在学部审定教科书的时候，学部里面就会有自己的代言人，发出自己的声音。
老大人见孙元起已经有了对策，这才提醒道：“其实，此次成立学部，对于你经世大学影响最大的，并非是教科书审定，而是学部的机构设置和章程起草。假如有人故意刁难，在里面做些手脚，纵然你说学校是洋人所办，恐怕依然寸步难行。”
听了这番话，孙元起脸色凝重起来：这好比是后世的标准化组织，你的产品再好、体系再完整，只要在组织内没有话语权、和组织的规章制度有冲突，不须手段，三下五除二就能把你打落凡尘
“原先，学务处有三个管学大臣：张埜秋，荣华卿，再加上老夫。如今张埜秋已调任户部尚书，老夫也垂垂老矣，以后成立学部，尚书定然是荣华卿。”老大人口中的荣华卿，就是现在孙元起的顶头上司荣庆，“荣华卿旧学出身，对于新学知之甚少，等他执掌学部，必然要倚借他人之力来设置机构和起草章程。前年奏准的各级学堂章程，便主要是你拟写的。只要你和荣华卿多多沟通，他肯定还会借重于你。到那时候，学部究竟应该如何，还不是看你和荣华卿两人所言？”
虽然孙元起对那荣庆不感冒，不过形势比人强，少不得多上门拜访几次，送些稀奇的礼物。在1905年12月6日，根据政务处大臣与管学大臣商量结果，老佛爷批准设立学部。以荣庆为尚书，熙瑛为左侍郎，而刚出任翰林院侍讲学士不久的孙元起为“署右侍郎”，也就是临时代理的意思。
经过调整，学部排在吏部之后、礼部之前，成为显赫一时的衙门。学部开设之初，几乎所有的重要文件，都是孙元起、罗振玉、张元济、严复等经世大学老师起草的，体现了浓重的现代大学气息，为中国教育的现代化做出了不可磨灭的贡献。
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