此时大学士周延儒刚被遂出京城，顶替他的是温体仁，回道：“皇上，如今陕西已被贼军所占，三边总督洪承畴下落不明，唯有在河南的山陕总督曹文诏手握重兵，皇上还需速下诏，令曹总督返回山西剿灭贼军才行。”
崇祯迟疑了一下，曹文诏刚来军报，已大败河南贼军，正要乘胜追剿，若回到山西岂不功亏一篑。
张凤翼见皇帝迟疑，知是担心河南的剿贼事宜，忙道：“皇上务需担心河南贼军，副总兵左良玉多次败贼立功，可堪重任。皇上可升其为总兵，负责河南余贼征剿事宜，左良玉心感皇恩浩荡，必不负皇上鸿恩。”
崇祯见众臣再也拿不出更好的办法来，只好传旨，令曹文诏火速回山西救援太原，并升左良玉为总兵，负责河南余贼的征缴。
曹文诏正在对河南的义军穷追猛打，接到山西告急的情报，军心已是不稳，官兵大多是山西人，老家被抄，自然都想回去救援，但曹文诏深知，此时正是全歼河南贼军之时，若是放过，转眼恐怕贼势又灸，那时官兵被左右夹击更是可怕。只得传令加快进攻步伐，先消灭河南贼军，再回师救山西。
高迎祥部更是立不住脚，一日数败，原先的县城一个个丢弃，张献忠，罗汝才等人趁机和高迎祥分道扬镳，独领人马进入湖北的十堰郧县一带，高迎祥退到河南的南阳一带，身边只剩数千人。
曹文诏正想再接再厉，彻底消灭高迎祥所部，朝庭的旨意已来到，加上将士纷纷思归，曹文诏无奈，只得将河南的剿贼事宜托付给左良玉，自已率大军回军。
李鸿基攻占了运城，临汾，晋城，长治等数十个府县，每个地方都要分兵留守，小的县城只有数百，大的有数千，由其是靠近河南的运城，晋城等地区，更是得驻重兵，出潼关的十万人马，加上新招附的五万人马共十五万人不断被摊薄，到了攻下祁县，交城时李鸿基身边只剩不到二万人马了。对太原已经是力不从心，但还是作出一副随时准备进攻太原的样子。
李鸿基所占的这些地方本来去年闹过兵灾，开始是义军到来，将大户官绅人家全都杀尽抢光，因义军待的时间不长，吃大户就足够了，一般的民众跟在后面还能得到了一点好处，但官兵来了就不一样，有道是“贼过如筛，兵过如洗。”
曹文诏的大军虽然比一般官军军纪要好一点，但也只有做到不杀人放火而已，至于军需负担自然要压在一般民众头上，因此百姓都叫苦连天，大家竟然巴不得官军快走，见又来了一支大军，即不抗拒也不欢迎，后来见到这只jūn_duì军容严整，买卖公平，占领了一个地方后马上开展民政，给老百姓分粮分地，当地百姓马上就拥护起这支jūn_duì来，虽然才来一个多月，已站稳了脚跟。
义军虽然是不事生产，靠流窜抢掠为生，但只要在一个地方待的不久，对地方的危害就不大，因为有富户可抢，谁会去抢穷人，只有在一个地方盘据日久，从富户那里抢回来的东西用尽时，才会对一般农户下手。
